Helixfold
Dobre uma cadeia de resíduos através de uma grade para que as unidades hidrofóbicas se amontoem em um núcleo enterrado – e reduza a energia ao seu mínimo comprovado.
Como jogar
Uma proteína é modelada como uma cadeia de resíduos hidrofóbicos (H) e polares (P) em uma rede 2D. Vizinhos hidrofóbicos que ficam adjacentes sem estarem ligados diminuem a energia. Seu objetivo é dobrar a cadeia para que os resíduos de H formem um núcleo compacto e você atinja a energia ideal.
- Clique em um resíduo para girar a cauda da corrente em torno dele.
- Clique alternadamente no mesmo resíduo para girar na direção oposta.
- Use o botão Girar para inverter a direção padrão do pivô (sentido horário/anti-horário).
- Alcance a energia mínima provável para a corrente vencer o quebra-cabeça.
Controles
- Área de trabalho: clique nos resíduos para girar, clique novamente para reverter, alterne Girar e use Redefinir para endireitar.
- Telefone e tablet: toque nos resíduos para girar - totalmente compatível com o toque.
Dicas e estratégia
- Conte os contatos H-H, não a forma - cada par hidrofóbico não ligado que termina adjacente diminui a energia.
- Procure uma bolha compacta em vez de um braço longo; a área de superfície exposta por resíduos de H é energia desperdiçada.
- Quando uma dobra parar, reinicie e tente semear primeiro o núcleo do aglomerado mais denso de resíduos H.
O que você aprenderá
Helixfold é construído sobre o modelo clássico de rede hidrofóbica-polar de enovelamento de proteínas, transformando a busca por uma dobra em um quebra-cabeça.
- Habilidades: bioquímica, enovelamento de proteínas, modelo HP, otimização
- Melhor para: ensino médio/faculdade avançada
- Para pais e professores: o modelo HP de enovelamento de proteínas.
Sobre Helixfold
Helixfold é construído sobre o clássico modelo de rede hidrofóbica-polar de enovelamento de proteínas, transformando a busca por uma conformação de energia mínima em um quebra-cabeça tátil. É um jogo de navegador original e gratuito com três comprimentos de cadeia e modos diários e de prática.
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